ACCUEIL

Consignes aux
auteurs et coordonnateurs
Nos règles d'éthique

APPEL À
CONTRIBUTION
Décisions, argumentation et traçabilité dans l’Ingénierie des Systèmes d’Information
En savoir plus >>
Autres revues >>

Ingénierie des Systèmes d'Information

Networking and Information Systems
1633-1311
Revue des sciences et technologies de l'information
 

 ARTICLE VOL 7/1-2 - 2002  - pp.45-61  - doi:10.3166/isi.7.1-2.45-61
TITRE
Collecte et intégration de données biologiques hétérogènes sur le web

RÉSUMÉ
La réponse à une question biologique donnée nécessite souvent l'interrogation de multiples ressources réparties et accessibles par le web. Le travail présenté ici s'inscrit dans le cadre de l'intégration de sources hétérogènes structurées en prenant en compte les spécificités identifiées des sources de données biologiques. Les problèmes rencontrés ont été analysés pour rechercher les pathologies orphelines colocalisées avec un gène d'intérêt. Le scénario de recherche d'information a été formalisé et un modèle générique est proposé pour l'interrogation des sources. Une DTD XML nous permet de représenter les données collectées. Ces propositions ont donné lieu à deux prototypes, Xmap_INTERACTIF et Xmap_AUTO. Les résultats d'un test impliquant 164 gènes sont analysés.


ABSTRACT
Answering biological questions frequently requires multiple queries through various sources disseminated on the web. The context of the work presented here is integration of heterogeneous data sources taking into account specificities of biological sources. Encountered problems have been analyzed upon retrieving orphan pathologies colocalized with a given human gene. An information retrieval scenario has been formalized and a generic model is proposed for source querying. A XML DTD allows representation of collected data. These proposals have been implemented in two prototypes Xmap_INTERACTIF and Xmap_AUTO. Results of a test involving 164 genes are analyzed.


AUTEUR(S)
Marie-Dominique DEVIGNES, André SCHAAFF, Malika SMAÏL

MOTS-CLÉS
recherche d'information, documents structurés, web, XML, intégration de sources de données hétérogènes, pathologies orphelines, cartographie des gènes humains.

KEYWORDS
information retrieval, structured documents, web, XML, integration of heterogeneous data sources, orphan pathologies, mapping of human genes.

LANGUE DE L'ARTICLE
Français

 PRIX
• Abonné (hors accès direct) : 12.5 €
• Non abonné : 25.0 €
|
|
--> Tous les articles sont dans un format PDF protégé par tatouage 
   
ACCÉDER A L'ARTICLE COMPLET  (2,2 Mo)



Mot de passe oublié ?

ABONNEZ-VOUS !

CONTACTS
Comité de
rédaction
Conditions
générales de vente

 English version >> 
Lavoisier